DETEKSI GEN blaTEM DAN GEN floR PADA ISOLAT KLINIS Salmonella typhi DENGAN METODE DUPLEX PCR

Authors

  • Adellya Mirza Putriyani Sekolah Tinggi Ilmu Kesehatan Nasional
  • Dewi Saroh Sekolah Tinggi Ilmu Kesehatan Nasional

DOI:

https://doi.org/10.51544/jalm.v11i1.6059

Keywords:

Gen blaTEM, Gen floR, Salmonella typhi, Duplex PCR

Abstract

Latar belakang: Salmonella typhi merupakan bakteri penyebab infeksi demam tifoid. Diagnosis laboratorium bakteri Salmonella thypi dapat dilakukan secara molekuler yang bertujuan untuk mendeteksi gen DNA pada bakteri yang diperiksa.

Tujuan: untuk mengetahui ada tidaknya gen blaTEM dan gen floR pada isolat klinis Salmonella typhi yang diperoleh dari RS Universitas Sebelas Maret dan RSUD Dr. Moewardi.

Metode: analisis deskriptif. Sampel yang digunakan adalah isolat klinis Salmonella typhi dari pasien demam tifoid di RS Universitas Sebelas Maret dan RSUD Dr. Moewardi.

Hasil: penelitian diperoleh bahwa gen blaTEM resisten terhadap antibiotik ampisilin yang terdeteksi pada panjang produk 643 bp dan gen floR resisten terhadap antibiotik kloramfenikol yang terdeteksi pada panjang produk 250 bp pada isolat klinis Salmonella typhi dengan menggunakan metode duplex Polymerase Chain Reaction.

Kesimpulan: Hasil penelitian menunjukkan bahwa dari 12 sampel isolat bakteri, ditemukan gen blaTEM (643 bp) dan gen floR (250 bp) pada Salmonella typhi.

Dengan metode Duplex PCR, hasil ini menunjukkan bahwa sampel darah pasien demam tifoid tersebut resisten terhadap antibiotik ampisilin dan kloramfenikol.

Downloads

Download data is not yet available.

References

Ahmed, D., Nahid, M. A., Sami, A. B., Halim, F., Akter, N., Sadique, T., Rana, M. S., Shahriar Bin Elahi, M., & Rahman, M. M. (2017). Bacterial etiology of bloodstream infections and antimicrobial resistance in Dhaka, Bangladesh, 2005-2014. Antimicrob Resist Infect Control, 6(2). https://doi.org/10.1186/s13756-016-0162-z

Alba, S., Bakker, M. I., Hatta, M., Scheelbeek, P. F. D., Dwiyanti, R., Usman, R., Sultan, A. R., Sabir, M., Tandirogang, N., Amir, M., Yasir, Y., Pastoor, R., Berrs, S. van, & Smits, H. L. (2016). Risk Factors of Typhoid Infection in the Indonesian Archipelago. PLoS ONE. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0155286. eCollection 2016

Amanda, K., Sari, R., & Apridamayanti, P. (2019). Optimalisasi Suhu Annealing Proses PCR Amplifikasi Gen shv Bakteri Escherichia coli Pasien Ulkus Diabetik. Jurnal Mahasiswa Farmasi Fakultas Kedokteran UNTAN, 4(1).

Anantham, S., Harmer, C. J., & Hall, R. M. (2015). p39R861-4, A Type 2 A/C2 Plasmid Carrying a Segment from the A/C1 Plasmid RA1. Microb Drug Resist, 21(6), 571–576. https://doi.org/10.1089/mdr.2015.0133

Bajpai, T., Pandey, M., Varma, M., & Bhatambare, G. S. (2017). Prevalence of TEM, SHV, and CTX-M Beta-Lactamase genes in the urinary isolates of a tertiary care hospital. Avicenna J Med, 7(1), 12–16. https://doi.org/10.4103/2231-0770.197508.

Bush, K. (2010). Alarming β-lactamase-mediated resistance in multidrug-resistant Enterobacteriaceae. Curr Opin Microbiol, 13(5), 558–564. https://doi.org/10.1016/j.mib.2010.09.006

CDC. (2019). Antibiotic resistance threats in the United States 2019. https://doi.org/http://dx.doi.org/10.15620/cdc:82532.

Crump, J. A., & Mintz, E. D. (2010). Global trends in typhoid and paratyphoid fever. Clin Infect Dis, 50(2), 241–246. https://doi.org/10.1086/649541

Ekasari, Y. S., & Saroh, D. (2021). Hubungan Titer Widal Dengan Jumlah Limfosit Pada Kasus Demam Tifoid Di Wilayah Kerja Puskesmas Sawoo. Jurnal Analis Laboratorium Medik, 6(2), 73–77. https://doi.org/10.51544/jalm.v6i2.2134

Fatchiyah, Arumingtyas, E. L., Widyarti, S., & Rahayu, S. (2011). Biologi molekuler prinsip dasar analisis. Penerbit Erlangga.

Hidayati, Saleh, E., & Aulawi, T. (2016). Identifikasi Keragaman Gen BMPR-1B (Bone Morphogenetic Protein Receptor IB) pada Ayam Arab Ayam Kampung dan Ayam Ras Petelur Menggunakan PCR-RLFP. Jurnal Peternakan, 13(1). https://doi.org/http://dx.doi.org/10.24014/jupet.v13i1.2383

Hikmatyar, M. F., Royani, J. I., & Dasumiati. (2015). Isolasi dan Amplifikasi DNA Keladi Tikus (Typonium flagellirofm) Untuk Identifikasi Keragaman Genetik. Jurnal Bioteknologi & Biosains Indonesia, 2(2), 42–48. https://doi.org/http://ejurnal.bppt.go.id/index.php/JBBI

Komalasari, K. (2019). Pengaruh Perbandingan Volume Darah Dan Lisis Buffer Serta Kecepatan Sentrifugasi Terhadap Kualitas Produk DNA Pada Sapi Friesian Holstein (Fh). Institut Pertanian Bogor.

Komariah, R., & Saroh, D. (2021). Hubungan Higiene Personal, Sanitasi Dan Tingkat Pengetahuan Terhadap Demam Tifoid. Jurnal Analis Laboratorium Medik, 6(2), 67–72. https://doi.org/10.51544/jalm.v6i2.2115

Kuswiyanto. (2017). Bakteriologi Buku Ajar Analis Kesehatan.

Lai, J., Wang, Y., Shen, J., Li, R., Han, J., Foley, S. L., & Wu, C. (2013). Unique class 1 integron and multiple resistance genes co-located on IncHI2 plasmid is associated with the emerging multidrug resistance of Salmonella Indiana isolated from chicken in China. Foodborne Pathog Dis, 10(7), 581–588. https://doi.org/10.1089/fpd.2012.1455

Levani, Y., & Prastya, A. D. (2020). Demam Tifoid : Manifestasi Klinis, Pilihan Terapi dan Pandangan Islam. Al-Iqra Medical Journal : Jurnal Berkala Ilmiah Kedokteran, 3(1). https://doi.org/https://doi.org/10.26618/aimj.v3i1.4038

Muhammad, A., Nurulita, N. A., & Budiman, A. (2017). Uji sensitivitas antibiotik terhadap bakteri penyebab infeksi saluran kemih pada pasien rawat inap RSUD Prof Dr Margono Soekarjo Purwokerto. Jurnal Pharmacy, 14(02). https://doi.org/https://doi.org/10.30595/pharmacy.v14i2.1684

Ni’mah, A., Kartikasari, Y., Pratama, A. D., Kartikasari, L. R., Hertanto, B. S., & Cahyadi, M. (2016). Detection of Pork Contamination in Fresh and Cooked Beef Using Genetic Marker Mitochondrial-DNA Cytochrome B by Duplex PCR. Journal of the Indonesian Tropical Animal Agriculture, 41(1). https://doi.org/https://doi.org/10.14710/interaksi.%25v.%25i.220%20-%20227

Putri, S. P., Anggraeni, R., & Novalina, D. (2025). Hubungan Trombositopenia Dengan Infeksi Salmonella typhi Pada Pasien Demam Tifoid Di RS PKU Muhammadiyah Yogyakarta. Jurnal Analis Laboratorium Medik, 10(2), 137–147. https://doi.org/10.51544/jalm.v10i2.6387

Rahman, B. A., Wasfy, M. O., Maksoud, M. A., Hanna, N., Dueger, E., & House, B. (2014). Multi-drug resistance and reduced susceptibility to ciprofloxacin among Salmonella enterica serovar Typhi isolates from the Middle East and Central Asia. New Microbes New Infect, 2(4), 88–92. https://doi.org/10.1002/nmi2.46

Sasmito, D. E. K., Kurniawan, R., & Muhimmah, I. (2014). Karakteristik Primerpada Polymerase Chain Reaction (PCR)untuk Sekuensing DNA: Mini Review. Seminar Nasional Informatika Medis (SNIMed) V 2014.

Taylor, S., Wakem, M., Dijkman, G., Alsarraj, M., & Nguyen, M. (2010). A practical approach to RT-qPCR—Publishing data that conform to the MIQE guidelines. Methods, 50, S1–S5. https://doi.org/10.1016/j.ymeth.2010.01.005

WHO. (2018). Typhoid vaccines: WHO position paper - March 2018. http://www.who.int/wer

Yahya, A., Firmansyah, M., Arlisyah, A., & Risandiansyah, R. (2017). Comparison of DNA Extraction Methods Between Conventional, Kit, Alkali and Buffer-Only for PCR Amplification on Raw and Boiled Bovine and Porcine Meat. Agricultural and Food Sciences, 7, 110–114. https://doi.org/https://doi.org/10.21776/ub.jels.2017.007.02.09

Downloads

Published

2026-06-02

How to Cite

Putriyani, A. M., & Saroh, D. (2026). DETEKSI GEN blaTEM DAN GEN floR PADA ISOLAT KLINIS Salmonella typhi DENGAN METODE DUPLEX PCR. JURNAL ANALIS LABORATORIUM MEDIK, 11(1), 32–41. https://doi.org/10.51544/jalm.v11i1.6059